Špičkové pracoviště kardiovaskulární a transplantační chirurgie se nachází v Brně na Pekařské ulici. Je nositelem certifikátu kvality, jsou zde trvale uplatňovány nejmodernější diagnostické a léčebné postupy v oblasti kardiovaskulárních onemocnění a transplantací. Centrum kardiovaskulární a transplantační chirurgie Brno je zařazeno do mezinárodních klinických studií, při kterých se ověřují nejnovější poznatky. Lékaři centra se věnují vědecko-výzkumné činnosti, podílejí se na výuce svých kolegů a představitelů nelékařských zdravotnických profesí. Hlavní pracovní náplní chirurgické části jsou operace srdce a velkých cév, transplantace srdce, jater a ledvin. V Centru se provádějí operace srdce dospělých a korekce vrozených vad u dětí. Nejpočetnější skupina pacientů trpí ischemickou chorobou srdeční, při operacích jsou jim prováděny rekonstrukční výkony na levé komoře. Používají se při nich moderní biologické materiály se schopností vrůstání buněk srdečního svalstva. V posledních letech se prudce rozvíjí chlopenní chirurgie, protože narůstá počet pacientů s aortální stenózou už v mladším věku nebo naopak ve vyšších věkových kategoriích. Pokud není možné stávající chlopně zachovat, nahrazují se mechanickými.
Transplantace orgánů se v Centru provádí od jeho vzniku, ročně se jich v Brně provádí více než sto a pracoviště se tak zařadilo na druhé místo v ČR. V Brně se postupně vytvořil multidisciplinární tým lékařů se všemi zainteresovanými odbornostmi i vysoce kvalifikovaný tým sester. Nejmladším programem je transplantace srdce, provádí se od roku 1992. Ročně je to 25 až 30 transplantací a 10 až 12 implantací kardiostimulátorů. Transplantace jater jsou chloubou pracoviště, použití vysoce účinných antivirotik umožňuje zdejším pacientům úplné vyléčení a zabraňuje opětovnému onemocnění hepatitidou C. Při transplantaci ledvin se používají orgány od zemřelých i žijících dárců, ročně je tento výkon proveden u padesátky nemocných.
